豪斯医生数据挖掘之WGCNA详解资源简介:
课程特色:
加权基因共表达网络(WGCNA)是生物信息学课程中一种高级的方法,其目的是最终从成千上万的基因中寻找到具有生物学意义的核心基因。该方法不同于我们之前的课程,不在局限于测序或芯片的一般分析,而是结合研究者的实际需要,找出最具有价值的1个或几个基因。也恰恰因为这点,对于目前手头上有高通量数据而不知如何着手,或者对那些因为课题经费不足,而无法展开预试验的研究人员,该方法的出现,为大家打开了另外一个思路。很多学者也是通过利用该方法在国际顶级期刊(Nature)发表相关的文章。
该课程是目前市场上介绍WGCNA最为详尽的资料,详细地介绍了WGCNA的理论和算法,不至于学员在跑代码过程中不知所以然,同时结合一个真实的数据,将WGCNA整个流程从头到尾跑了一遍。过程中对R的语法有较为仔细的讲解。所以,对于没有编程基础的同学,也不必担心。只要多看几遍,就能熟悉和掌握。
课程目录
课时01.使用cytoscape寻找核心基因.MP4
课时02.WGCNA理论和算法1.mp4
课时03.WGCNA理论和算法2.mp4
课时04.WGCNA理论和算法3.mp4
课时05.WGCNA理论和算法4.mp4
课时06.输入文件准备.mp4
课时07.寻找基因模块.mp4
课时08.与临床信息相结合.mp4
课时09.确定核心基因.mp4
医学方豪斯医生WGCNA配套代码.pdf
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标题:豪斯医生数据挖掘之WGCNA详解
在医学研究中,数据挖掘技术的应用越来越广泛。其中,WGCNA(加权基因共表达网络分析)是一种强大的工具,它可以帮助我们理解复杂的生物系统。本文将以豪斯医生为例,详细解析WGCNA的使用方法和优势。
WGCNA是一种基于网络的方法,它可以将大量的基因表达数据转化为有意义的生物学信息。这种方法的主要优点是可以处理大量的数据,并且可以发现数据中的复杂模式。在豪斯医生的研究中,WGCNA被用来研究各种疾病的基因表达模式。
首先,我们需要收集大量的基因表达数据。这些数据可以从公开的数据库中获取,也可以通过实验得到。然后,我们需要使用WGCNA软件对这些数据进行分析。在这个过程中,我们可以选择一些关键参数,如软阈值、模块大小等,这些参数的选择会影响到分析的结果。
在豪斯医生的研究中,我们发现了一些有趣的结果。例如,我们发现某些基因的表达模式与某种疾病的发展密切相关。这些结果为我们提供了新的研究方向,也为我们提供了治疗这种疾病的可能方法。
总的来说,WGCNA是一种强大的工具,它可以帮助我们理解复杂的生物系统。在豪斯医生的研究中,我们通过使用WGCNA,发现了一些有趣的基因表达模式,这些结果为我们提供了新的研究方向。在未来,我们期待看到更多的研究使用WGCNA来探索生物系统的复杂性。
然而,WGCNA也有其局限性。例如,它需要大量的计算资源,而且对于数据的质量和预处理有很高的要求。此外,WGCNA的结果需要进一步的实验验证。因此,我们在使用WGCNA时,需要谨慎对待其结果。
尽管如此,WGCNA仍然是一个值得我们深入研究的工具。在豪斯医生的研究中,我们已经看到了它的强大潜力。在未来,我们期待看到更多的研究使用WGCNA来探索生物系统的复杂性。